Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GINM1Q9NU53 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GINM1Q9NU53 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
GINM1Q9NU53 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GINM1Q9NU53 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
GINM1Q9NU53 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GINM1Q9NU53 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
GINM1Q9NU53 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
GINM1Q9NU53 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GINM1Q9NU53 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
GINM1Q9NU53 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GINM1Q9NU53 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
GINM1Q9NU53 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms