Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FOXD4L1Q9NU39 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
FOXD4L1Q9NU39 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
FOXD4L1Q9NU39 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FOXD4L1Q9NU39 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
FOXD4L1Q9NU39 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FOXD4L1Q9NU39 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 619.3 ms