Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TOPORSQ9NS56 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TOPORSQ9NS56 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOPORSQ9NS56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOPORSQ9NS56 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TOPORSQ9NS56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TOPORSQ9NS56 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TOPORSQ9NS56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms