Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CYTL1Q9NRR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CYTL1Q9NRR1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CYTL1Q9NRR1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CYTL1Q9NRR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CYTL1Q9NRR1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms