Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ARHGEF3Q9NR81 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ARHGEF3Q9NR81 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ARHGEF3Q9NR81 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ARHGEF3Q9NR81 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ARHGEF3Q9NR81 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ARHGEF3Q9NR81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms