Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR64

KLHL1, Kelch-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL1Q9NR64 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL1Q9NR64 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLHL1Q9NR64 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLHL1Q9NR64 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLHL1Q9NR64 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KLHL1Q9NR64 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KLHL1Q9NR64 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms