Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR21

PARP11, Poly [ADP-ribose] polymerase 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP11Q9NR21 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PARP11Q9NR21 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PARP11Q9NR21 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PARP11Q9NR21 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PARP11Q9NR21 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PARP11Q9NR21 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PARP11Q9NR21 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms