Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NRIP3Q9NQ35 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NRIP3Q9NQ35 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NRIP3Q9NQ35 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NRIP3Q9NQ35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NRIP3Q9NQ35 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NRIP3Q9NQ35 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms