Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP56

PDE7B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7B, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7BQ9NP56 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDE7BQ9NP56 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDE7BQ9NP56 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDE7BQ9NP56 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PDE7BQ9NP56 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PDE7BQ9NP56 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PDE7BQ9NP56 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
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