Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS7

XAB2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XAB2Q9HCS7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
XAB2Q9HCS7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XAB2Q9HCS7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XAB2Q9HCS7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XAB2Q9HCS7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
XAB2Q9HCS7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
XAB2Q9HCS7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
XAB2Q9HCS7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms