Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1BQ9H9Y6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1BQ9H9Y6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
POLR1BQ9H9Y6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR1BQ9H9Y6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR1BQ9H9Y6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms