Protein–RNA interactions for Protein: Q9H799

C5orf42, Protein JBTS17, humanhuman

Predictions only

Length 3,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf42Q9H799 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
C5orf42Q9H799 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
C5orf42Q9H799 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C5orf42Q9H799 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C5orf42Q9H799 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
C5orf42Q9H799 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
C5orf42Q9H799 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
C5orf42Q9H799 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms