Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
BCAS3Q9H6U6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
BCAS3Q9H6U6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
BCAS3Q9H6U6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
BCAS3Q9H6U6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BCAS3Q9H6U6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
BCAS3Q9H6U6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
BCAS3Q9H6U6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms