Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C11orf49Q9H6J7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
C11orf49Q9H6J7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
C11orf49Q9H6J7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
C11orf49Q9H6J7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
C11orf49Q9H6J7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
C11orf49Q9H6J7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
C11orf49Q9H6J7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
C11orf49Q9H6J7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
C11orf49Q9H6J7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C11orf49Q9H6J7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C11orf49Q9H6J7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C11orf49Q9H6J7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C11orf49Q9H6J7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms