Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4M9

EHD1, EH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1Q9H4M9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD1Q9H4M9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD1Q9H4M9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EHD1Q9H4M9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EHD1Q9H4M9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EHD1Q9H4M9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EHD1Q9H4M9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms