Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4B8

DPEP3, Dipeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPEP3Q9H4B8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
DPEP3Q9H4B8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DPEP3Q9H4B8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DPEP3Q9H4B8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DPEP3Q9H4B8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DPEP3Q9H4B8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DPEP3Q9H4B8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DPEP3Q9H4B8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms