Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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