Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LRRN3Q9H3W5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LRRN3Q9H3W5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
LRRN3Q9H3W5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRN3Q9H3W5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRN3Q9H3W5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms