Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2V7

SPNS1, Protein spinster homolog 1, humanhuman

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Length 528 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1Q9H2V7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPNS1Q9H2V7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPNS1Q9H2V7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPNS1Q9H2V7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPNS1Q9H2V7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPNS1Q9H2V7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SPNS1Q9H2V7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPNS1Q9H2V7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPNS1Q9H2V7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPNS1Q9H2V7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPNS1Q9H2V7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPNS1Q9H2V7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
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