Protein–RNA interactions for Protein: Q9H201

EPN3, Epsin-3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPN3Q9H201 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPN3Q9H201 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
EPN3Q9H201 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
EPN3Q9H201 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EPN3Q9H201 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EPN3Q9H201 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPN3Q9H201 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPN3Q9H201 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPN3Q9H201 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPN3Q9H201 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPN3Q9H201 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms