Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Z9

TSPAN10, Tetraspanin-10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN10Q9H1Z9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSPAN10Q9H1Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSPAN10Q9H1Z9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TSPAN10Q9H1Z9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSPAN10Q9H1Z9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TSPAN10Q9H1Z9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TSPAN10Q9H1Z9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms