Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q3

FXYD6, FXYD domain-containing ion transport regulator 6, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD6Q9H0Q3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FXYD6Q9H0Q3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
FXYD6Q9H0Q3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FXYD6Q9H0Q3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FXYD6Q9H0Q3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FXYD6Q9H0Q3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms