Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NACA2Q9H009 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
NACA2Q9H009 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NACA2Q9H009 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NACA2Q9H009 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NACA2Q9H009 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NACA2Q9H009 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NACA2Q9H009 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NACA2Q9H009 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NACA2Q9H009 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NACA2Q9H009 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NACA2Q9H009 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NACA2Q9H009 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NACA2Q9H009 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NACA2Q9H009 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NACA2Q9H009 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
NACA2Q9H009 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NACA2Q9H009 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NACA2Q9H009 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NACA2Q9H009 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NACA2Q9H009 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NACA2Q9H009 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms