Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMEM39BQ9GZU3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMEM39BQ9GZU3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMEM39BQ9GZU3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMEM39BQ9GZU3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMEM39BQ9GZU3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMEM39BQ9GZU3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMEM39BQ9GZU3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TMEM39BQ9GZU3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TMEM39BQ9GZU3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TMEM39BQ9GZU3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TMEM39BQ9GZU3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TMEM39BQ9GZU3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TMEM39BQ9GZU3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms