Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLIRPQ9GZT3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLIRPQ9GZT3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLIRPQ9GZT3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLIRPQ9GZT3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLIRPQ9GZT3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLIRPQ9GZT3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms