Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP7

VN1R1, Vomeronasal type-1 receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R1Q9GZP7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VN1R1Q9GZP7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
VN1R1Q9GZP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VN1R1Q9GZP7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VN1R1Q9GZP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VN1R1Q9GZP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VN1R1Q9GZP7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms