Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN1

ACTR6, Actin-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR6Q9GZN1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTR6Q9GZN1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTR6Q9GZN1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACTR6Q9GZN1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACTR6Q9GZN1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACTR6Q9GZN1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACTR6Q9GZN1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms