Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CIPCQ9C0C6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CIPCQ9C0C6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CIPCQ9C0C6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CIPCQ9C0C6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CIPCQ9C0C6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CIPCQ9C0C6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CIPCQ9C0C6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms