Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTPBP4Q9BZE4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GTPBP4Q9BZE4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTPBP4Q9BZE4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GTPBP4Q9BZE4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTPBP4Q9BZE4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTPBP4Q9BZE4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms