Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
KRTAP9-2Q9BYQ4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KRTAP9-2Q9BYQ4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KRTAP9-2Q9BYQ4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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