Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS0

COL25A1, Collagen alpha-1(XXV) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL25A1Q9BXS0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COL25A1Q9BXS0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COL25A1Q9BXS0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COL25A1Q9BXS0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
COL25A1Q9BXS0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COL25A1Q9BXS0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COL25A1Q9BXS0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
COL25A1Q9BXS0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
COL25A1Q9BXS0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COL25A1Q9BXS0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms