Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
JAM3Q9BX67 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
JAM3Q9BX67 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
JAM3Q9BX67 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
JAM3Q9BX67 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
JAM3Q9BX67 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms