Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EFHD1Q9BUP0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EFHD1Q9BUP0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EFHD1Q9BUP0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EFHD1Q9BUP0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EFHD1Q9BUP0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EFHD1Q9BUP0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms