Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU70

TRMO, tRNA (adenine(37)-N6)-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMOQ9BU70 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TRMOQ9BU70 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRMOQ9BU70 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRMOQ9BU70 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRMOQ9BU70 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMOQ9BU70 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMOQ9BU70 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMOQ9BU70 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMOQ9BU70 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMOQ9BU70 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMOQ9BU70 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMOQ9BU70 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMOQ9BU70 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms