Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM43Q9BTV4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM43Q9BTV4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM43Q9BTV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM43Q9BTV4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM43Q9BTV4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms