Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NIPSNAP3BQ9BS92 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NIPSNAP3BQ9BS92 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NIPSNAP3BQ9BS92 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NIPSNAP3BQ9BS92 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms