Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG2

SH2D3A, SH2 domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D3AQ9BRG2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SH2D3AQ9BRG2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SH2D3AQ9BRG2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SH2D3AQ9BRG2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SH2D3AQ9BRG2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SH2D3AQ9BRG2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SH2D3AQ9BRG2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SH2D3AQ9BRG2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms