Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EBF4Q9BQW3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EBF4Q9BQW3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EBF4Q9BQW3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EBF4Q9BQW3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF4Q9BQW3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF4Q9BQW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms