Protein–RNA interactions for Protein: Q99895

CTRC, Chymotrypsin-C, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRCQ99895 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTRCQ99895 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTRCQ99895 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTRCQ99895 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTRCQ99895 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTRCQ99895 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CTRCQ99895 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms