Protein–RNA interactions for Protein: Q99578

RIT2, GTP-binding protein Rit2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIT2Q99578 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIT2Q99578 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIT2Q99578 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
RIT2Q99578 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RIT2Q99578 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RIT2Q99578 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RIT2Q99578 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RIT2Q99578 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RIT2Q99578 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RIT2Q99578 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms