Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DCLRE1CQ96SD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCLRE1CQ96SD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DCLRE1CQ96SD1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DCLRE1CQ96SD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DCLRE1CQ96SD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DCLRE1CQ96SD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms