Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TGS1Q96RS0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TGS1Q96RS0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TGS1Q96RS0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TGS1Q96RS0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TGS1Q96RS0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TGS1Q96RS0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TGS1Q96RS0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms