Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNFRSF13CQ96RJ3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TNFRSF13CQ96RJ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF13CQ96RJ3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TNFRSF13CQ96RJ3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms