Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NR1H4Q96RI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NR1H4Q96RI1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NR1H4Q96RI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NR1H4Q96RI1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NR1H4Q96RI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NR1H4Q96RI1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NR1H4Q96RI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms