Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMG1Q96Q15 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMG1Q96Q15 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMG1Q96Q15 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMG1Q96Q15 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMG1Q96Q15 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SMG1Q96Q15 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SMG1Q96Q15 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMG1Q96Q15 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
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