Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PLIN4Q96Q06 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PLIN4Q96Q06 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PLIN4Q96Q06 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PLIN4Q96Q06 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PLIN4Q96Q06 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PLIN4Q96Q06 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PLIN4Q96Q06 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PLIN4Q96Q06 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PLIN4Q96Q06 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms