Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ODF3Q96PU9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ODF3Q96PU9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ODF3Q96PU9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ODF3Q96PU9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms