Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PGLYRP2Q96PD5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PGLYRP2Q96PD5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PGLYRP2Q96PD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PGLYRP2Q96PD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGLYRP2Q96PD5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PGLYRP2Q96PD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PGLYRP2Q96PD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PGLYRP2Q96PD5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms