Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NLRP3Q96P20 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
NLRP3Q96P20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
NLRP3Q96P20 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NLRP3Q96P20 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NLRP3Q96P20 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NLRP3Q96P20 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NLRP3Q96P20 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms