Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
LINC00167Q96N53 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC00167Q96N53 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LINC00167Q96N53 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00167Q96N53 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00167Q96N53 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms