Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CMTM3Q96MX0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CMTM3Q96MX0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CMTM3Q96MX0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CMTM3Q96MX0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CMTM3Q96MX0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms